Государственную проверку можно обжаловать

Результаты проверки, проведенной с грубым нарушением установленных требований, не могут являться доказательствами нарушения юридическим лицом, индивидуальным предпринимателем обязательных требований и требований, установленных муниципальными правовыми актами, и подлежат отмене вышестоящим органом государственного надзора или судом на основании заявления юридического лица, индивидуального предпринимателя. (ст.20 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ).
К грубым нарушениям при проверке государственного экологического надзора относятся: 
— проведение плановых проверок чаще, чем 1 раз в 3 года (ч.2 ст.9 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— отсутствие основания для включения проверяемого лица в ежегодный план проведения плановых проверок (ч.3 ст.9 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— неуведомление проверяемого лица о проведении плановой проверки контролирующем органом либо уведомление в срок позднее чем в течение трех рабочих дней до начала ее проведения (ч.12 ст.9 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— неуведомление проверяемого лица о проведении контролирующим органом внеплановой проверки на основании поступившей в органы государственного контроля, органы муниципального контроля информации о возникновении угрозы (причинения) причинения вреда жизни, здоровью граждан, вреда животным, растениям и т.д. (перечень определен п.2 ч.2 ст.10 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ), нарушении прав потребителей, а равно уведомление проверяемых лиц в срок менее чем за 24 часа до начала проведения мероприятий по контролю (ч.16 ст.10 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— привлечение к проведению мероприятий по контролю в качестве экспертов не аккредитованных в установленном порядке граждан и организаций (ч.7 ст.2 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— наличие в качестве основания проведения внеплановой проверки обращений и заявлений, не позволяющих установить лицо, обратившееся в орган государственного контроля (надзора), орган муниципального контроля, а также обращений и заявлений, не содержащих сведений о фактах, указанных в ч.2 ст.10 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ (п.2 ч.2, ч.3 ст.10 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ в части оснований проведения внеплановой выездной проверки);
— отсутствие согласования проведения внеплановой выездной проверки контролирующим органом с органами прокуратуры в установленном случае (ч.5 ст.10 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— нарушение сроков и времени проведения плановых выездных проверок в отношении субъектов малого предпринимательства — общий срок проведения плановой выездной проверки превысил пятьдесят часов для малого предприятия и пятнадцать часов для микропредприятия в год (ч.2 ст.13 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— проведение проверки при отсутствии распоряжения или приказа руководителя, заместителя руководителя органа государственного контроля (надзора), органа муниципального контроля (ч.1 ст.14 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— истребование в ходе проверки должностными лицами контролирующих органов документов, не относящиеся к предмету проверки (ч.3 ст.15 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— превышение установленных сроков (20 рабочих дней) проведения проверки (ч.6 ст.15 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— нарушение требования о вручении акта проверки по результатам проверки должностными лицами контролирующих органов, а также направлении впоследствии данного акта заказным почтовым отправлением с уведомлением в адрес проверяемого лица (ч.4 ст.16 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— проведение плановой проверки, не включенной в ежегодный план проведения плановых проверок (ч.3 ст.9 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ);
— нарушение требований о проведении выездной проверки в части участия в проведении проверок экспертов, экспертных организаций, состоящих в гражданско-правовых и трудовых отношениях с юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями, в отношении которых проводятся проверки (ч.3 ст.12 Федерального закона от 26.12.2008 г. N 294-ФЗ).
При наступлении перечисленных выше событий проверяемое лицо вправе произвести обжалование действий инспекторов экологического контроля.